อินโดนีเซียนำมาใช้ระบบการศึกษาที่มีคุณภาพสูงซึ่งมีการศึกษาในสามระดับขั้นพื้นฐานที่มีระดับสูงสุดเป็นระดับมหาวิทยาลัย เมื่อเร็ว ๆ นี้ประเทศปรับห้าวิทยาลัยให้อยู่ในระดับมหาวิทยาลัยอย่างเต็มที่กับจุดมุ่งหมายของการรองรับแม้แต่นักศึกษาต่างชาติที่อาจจะศึกษาในอินโดนีเซีย โปรแกรมการศึกษาที่สูงขึ้นในประเทศอินโดนีเซียได้รับการรับรองโดยคณะกรรมการได้รับการรับรองแห่งชาติเพื่อการอุดมศึกษา ประเทศ 's เมืองหลวงคือจาการ์ตา

ปริญญาเอกหรือ PhD อาจต้องใช้ระยะเวลาศึกษาแปดปีหรือมากกว่านั้นเพื่อทำวิทยานิพนธ์ ในสาขาวิชาส่วนใหญ่การได้รับปริญญาเอกจะทำให้ผู้ถือครองวุฒิการศึกษานี้เป็นศาสตราจารย์ในสาขาวิชานั้นๆ หลักสูตรนั้นมีให้ศึกษาอยู่หลากหลายหลักสูตร